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青少年憂郁的原因目前尚不清楚，關于憂郁癥或者抑郁癥的病因還在探討階段，目前比較一致的觀點是多因素疾病，若干個因素共同作用，使疾病發生。在諸多因素中，關鍵作用是遺傳，但不是唯一的因素，并非單基因遺傳病，而是多因素遺傳的方式，呈家族聚居性。如果家族出現抑郁癥病人，后代抑郁風險相比沒有抑郁患者的其他家族較高，但并不是每代均會患病。抑郁的發生，除遺傳外的其他因素有腦結構與功能變化，如神經生化學變化，社會心理學因素，如童年成長、創傷、不良遭遇等。成年后的社會壓力、不良事件打擊，以及人際關系等環境因素也參與疾病發生。綜合而言，青少年抑郁是基因與環境相互交互的結果。