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多重耐藥菌感染之后，早期的癥狀表現與非耐藥細菌感染沒有太大差別。多重耐藥菌可以引起身體各個部位感染，可以引起肺炎、膽囊炎 、腹腔感染、泌尿系統感染 、中樞神經系統感染、導管感染等，因為感染部位不同 ，差別較大，但相對于非耐藥細菌感染癥狀基本類似。所以單純從癥狀方面，很難判斷是耐藥細菌感染，還是非耐藥細菌感染。但是經過治療一段時間之后，可以基本分辨出來。因為耐藥細菌感染，如果選擇的抗菌藥物對細菌沒有敏感性 ，這種情況通過治療之后，患者的癥狀不會有所改善，有可能還出現加重。病人表現為持續高熱，以及局部相應癥狀。而如果感染的是非耐藥細菌，應用抗菌藥物之后，癥狀會明顯改善，恢復時間相對較快。所以在早期癥狀方面，其實沒有太多的差異，但經過治療之后，可能治療的效果會顯示出差別。