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無論是良性腫瘤還是惡性腫瘤，無論是神經系統的腫瘤還是其他部位的腫瘤，總的病因仍然不明確，女性患者如此，男性患者也同樣。部分腫瘤，在男性和女性中存在一定性別比例的差異，最明顯的是腦膜瘤，腦膜瘤患者女性明顯高于男性，根據性別比例的差異，可能認為雌激素參與了腦膜瘤的生成和發展，腦膜瘤只是腦腫瘤中的一種，腦膜瘤本身形成的因素也很復雜。腦腫瘤包括垂體瘤、膠質瘤、螺旋管瘤等，這些腫瘤發病因素都很復雜，可能和化學環境、化學物質、容易霉變，以及含苯環的化學物質、比較強烈的電離輻射有關，如果經常進行頭顱CT的掃描等，也被認為是腦腫瘤形成的原因之一。還有一部分腫瘤的形成可能是先天性的，如嬰幼兒，非常小的女童出現腫瘤，可能就是先天性腫瘤，這些都是腦腫瘤形成的原因。