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新生兒心臟有個洞說明有先天性心臟病，可以是房間隔缺損、室間隔缺損、動脈導管未閉，目前確切的原因不是很清楚，但是根據研究與以下因素有關系。一、內部因素:1、遺傳：最常見的病因就是內在的遺傳因素決定，假如父母有先天性心臟病，新生兒心臟有洞的可能性就非常大，明顯高于父母沒有先天性心臟病的可能性；2、染色體畸形：如果新生兒本身患有染色體的畸形，比如21-三體綜合征、18三體綜合征等染色體的畸形，或者是患有單基因病變，比如馬凡氏綜合征等，這些也都會引起先天性心臟病的發生。二、外部環境因素：1、化學因素：尤其是在母親懷孕的前3個月之內，遭受到外部環境因素影響，導致心臟會有個洞，早期有病毒感染，比如風疹病毒感染，就會容易出現房間隔缺損等先天性心臟病的情況，導致心臟有洞。或者是有一些服用了化學藥物，也會導致心臟有洞。或者是缺乏葉酸，或者還伴有其他的神經管畸形，這是化學的因素；2、物理因素：還有一部分是物理的因素，就是懷孕早期不知道懷孕，拍了片子、照了射線，也有可能會導致心臟有個洞。所以心臟有洞，多是由于內部和外部環境相互作用導致，可能本身有基因的缺陷，然后又受到了外部物理的射線影響，受到了生物、化學因素的影響，從而導致心臟有個洞無法閉合，使心臟的發育停滯在某一個階段，導致了先天性心臟病的發生。