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肺部真菌感染常繼發于嚴重的原發病，患者的癥狀、體征通常沒有特異性，某些隱匿性感染，患者甚至沒有一些明顯的癥狀、體征，患者可以自愈，但患者也會出現以下癥狀：1、流感癥狀：如發熱、畏寒、頭痛、流鼻涕、關節痛、肌肉痛等；2、肺部表現：患者的癥狀類似于肺炎、支氣管炎，可能與一般的細菌性肺炎不好鑒別，患者有發熱、咳嗽、咳痰等癥狀，甚至部分患者可以有咯血、胸悶、氣短等癥狀；3、結核樣表現：如細菌的組織胞漿菌病等，甚至有的患者癥狀類似肺結核，可以有干咳、低熱、盜汗、咯血、胸痛等癥狀，此外還有的患者可以形成膿腫、膿胸；4、其它癥狀：患者應用激素類藥物，以及存在免疫組織、結締組織病等，可繼發肺部真菌感，患者可以有寒戰、高熱，咳嗽、咳痰癥狀，甚至可以有異味，也可以出現痰中帶血。甚至有的患者，如存在隱球菌、組織胞漿菌病，可以有腫瘤樣表現，類似周圍型肺癌，因此應予以鑒別。