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新冠狀病毒的來源據目前研究發現，新冠病毒的核酸序列跟蝙蝠身上的冠狀病毒基因相似，新冠狀病毒的基因序列跟SASR、中東呼吸綜合征這兩種冠狀病毒的同源性達到了85％，目前考慮可能最早時病毒來源于蝙蝠，經過中間宿主如穿山甲的過渡，傳到人類身上。 在人類中適應之后，再造成人和人之間的傳播，但目前還沒有完全明確病毒的真正來源，還需要進一步研究。