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血液引出體外有可能會凝固需要抗凝治療，包括全身抗凝和局部抗凝，最常使用的全身抗凝用的是普通肝素和低分子肝素，局部抗凝最常見用的是枸櫞酸抗凝。 普通肝素價格便宜使用比較廣泛，而且靜脈使用時半衰期比較短可以和魚精蛋白對抗，就是用多了可以中和掉一些，血液透析時需要負荷量和維持量操作比較復雜，存在的風險有出血和肝素誘導性血小板減少癥。 相較于普通肝素，低分子肝素抑制的抗凝因子就比較單一，主要為Ⅹ因子，生物相容性和藥代動力學更為優越，從而血小板減少發生率比較低，低分子肝素的半衰期較長，非特異性結合比較少，抗凝效果更為可控，但是價錢稍微貴了一點，而且用多了沒有藥物對抗仍然有出血的風險。 枸櫞酸，體內的鈣是凝血因子，枸櫞酸可以和血液中的鈣結合導致血液不凝，輸出端加入枸櫞酸讓血液不凝，輸入端補充鈣劑同時保證體外循環的低鈣水平和體內鈣離子穩定，枸櫞酸抗凝安全有效不影響凝血系統功能，尤其適合在合并比較高出血風險的患者中使用，并發癥可能會有低鈣血癥、代謝性酸中毒和代謝性堿中毒。