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微浸潤癌和原位癌的主要區別是浸潤深度的區別。如果浸潤超過基底膜，但在微浸潤癌的浸潤深度范圍內，就屬于微浸潤癌。微浸潤癌是原位癌的繼續發展，原位癌指的是癌細胞局限在上皮層內，沒有穿透基底膜向深層發生浸潤。原位癌屬于癌的最早期階段，如果能夠在原位癌階段發現癌的存在，通常可以通過根治性手術切除治療，使原位癌獲得治愈，一般不會出現復發和轉移的情況，絕大多數預后比較好。如果在原位癌階段沒有發現或者積極治療，癌細胞就可以繼續向深層發生浸潤，可以穿透基底膜侵入基底膜深層的間質當中，這個時候就稱為微浸潤癌。微浸潤癌的浸潤深度通常不超過基底膜下的5mm，如果超過5mm，就不是微浸潤癌，而稱為浸潤性癌。微浸潤癌雖然大多數，也屬于早期，一般不發生復發和轉移，但癌細胞一旦穿透基底膜，還是有機會侵入到淋巴管或者血管當中，從而發生轉移的情況。所以對于微浸潤癌要更加積極的治療。