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精子被感染的原因通常是逆行感染，感染精子的病原體經尿道進入到射精管，通過前列腺而進入精索，沿著輸精管逆行，再繼續的感染，從而影響到附睪，最終感染到睪丸。通過此條逆行的感染途徑，最終會導致精子的感染。但是在精子途經的途徑中，如果任何一個部位已經出現炎癥，有時也會直接或間接地引起精子的感染。導致感染的常見病原體，包括細菌、病毒、支原體、衣原體、霉菌、滴蟲、螺旋體等，甚至包括寄生蟲。比如常見的大腸埃希菌、肺炎克雷伯菌、包皮桿菌、鏈球菌、葡萄球菌、腸球菌等，都是經常感染的細菌，支原體、衣原體也是比較常見的男性泌尿生殖系統感染的病原體。在感染了以后，可能造成精子數目的減少或者精子活動率的下降，有些還會影響到精子存活率或者精子畸形率。因此精子被感染，應該積極治療，以免影響到生育功能。