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膽源性胰腺炎引起原因涉及到膽源性胰腺炎的定義和概念，目前教科書和很多指南中定義是因為膽總管結石、膽囊結石、肝內膽管結石在排出過程中引起的胰腺炎叫膽源性胰腺炎，所以統稱為膽石性胰腺炎。 還有一部分患者為非結石性膽源性腺炎，發病在膽胰匯合部，如十二指腸乳頭、十二指腸乳頭炎、乳頭過長、硬化性乳頭炎、萎縮性乳頭炎、乳頭旁憩室等引起膽胰流出道不暢。同時，患者出現低位膽液合流異常，或者高位膽胰合流異常。這部分病人在飲酒、進高脂飲食的時候，容易出現膽汁逆流到胰管，激活胰酶發生胰腺炎。 病人若是單純取結石或者切膽囊，往往術后復發率會高，效果不理想。所以膽源性胰腺炎的發生機理是膽管胰酶被激活，通常是十二指腸液或是腸液還有膽汁激活。激活的路徑是通過膽胰匯合部，膽管、胰管在乳頭上有隔膜，隔膜缺失或者關閉不全情況下，腸液、膽汁容易反流到膽管，反流到胰管激活胰酶發生胰腺炎。所以對這部分病人要根據發病原因、發病機理進行治療，即通暢胰管流出道，通過ERCP技術解決，復發性胰腺炎患者中大概90%需要通過ERCP解決。