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原發性肝癌首選影像學檢查是B超，對于B超發現的實性占位，需要進一步檢查肝臟增強CT或核磁共振。核磁共振檢查對肝臟等軟組織分辨率有時可強于CT。根據肝臟腫瘤不同時期的血流成像，如動脈期，門靜脈期和延遲期成像特點，可以對原發性肝癌、繼發性肝癌，以及膽管癌做出基本診斷。 血液學檢驗如甲胎蛋白，具有病毒性肝炎背景是肝細胞肝癌診斷依據；CA199檢驗是膽管細胞癌診斷依據；癌胚抗原陽性是結直腸癌診斷指標。肝腫瘤活檢穿刺檢查獲得病理診斷是診斷肝腫瘤最確鑿依據，但由于有創性，且可能通過針道轉移，臨床上并不常用。病人一般情況，即全身狀態評估檢查也很必要，如大生化檢查中肝功能、血糖、血脂、肝腎功能等，凝血功能、血型、血常規等。心肺、腦血管評估檢查如心電圖、心臟彩超、肺功能、胸片、頸部動脈等超聲檢查。根據患者情況不同，由專科醫生指導下進行檢查。