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臨床上HPV39與亞型HPV16、HPV18、HPV52、HPV58，甚至HPV33這幾種亞型相比，在我國，乃至整個亞洲人群，陽性率或者是陽性的檢出率確實明顯降低。盡管HPV39在臨床上不是最為常見的高危HPV亞性，但仍然被列入高危亞型之一，只要是被列入高危亞型的人乳頭瘤病毒，仍然需要根據宮頸的一級細胞學檢查結果，或者進行陰道鏡下活檢，根據活組織病理檢查來決定下一步的處理方案以及隨診方案。 整個人群中應用不同的檢測方法，HPV亞型在不同地區的分布陽性率不一樣，比方在我國HPV52、HPV58高居前兩位，甚至有的時候可能遠遠比HPV16和HPV18更為常見，只能代表在我國這樣的一個地區HPV52和HPV58占據主要的病毒亞型，但是不能因為占有率比較高、陽性率比較高，就說明致癌的風險高，也不能說明HPV39的陽性率不是特別高。