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和大多數惡性腫瘤類似，腎盂癌的確切病因目前尚不清楚，近10年來的腫瘤流行病學顯示以下幾個因素可能與腎盂癌的發病有關：1、遺傳因素：臨床發現腎癌有一定的家族聚集現象，但一定是一個多基因相關的致病情況，因為目前沒有發現具體哪些基因突變會導致腎盂癌；2、職業暴露：目前的研究表明，比如從事化工、顏料行業的從業人員，腎盂癌的發病率顯著上升；3、中藥因素：在中國，腎盂癌有一些特定的原因，比如長期服用的中藥中含有馬兜鈴酸，可能會造成腎功能不全，同時會造成包括腎盂癌在內的上尿路移行細胞癌的發病率上升。這是因為馬兜鈴酸在體內代謝后，會形成一些含硝基的物質，這是一種高致癌物，因此在用藥中一定要注意；4、腎盂疾病：腎盂癌還有一些和腎盂內的慢性感染、結石有關。