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金黃色葡萄球菌的感染，如果治療方法得當，治療的療程足夠，大多數患者可以根治，常見的包括以下幾種：1、 皮膚軟組織的感染：如果小的癤腫直徑＜5cm，或者甲溝炎，膿腫可以自行穿破或通過引流，一般絕大多數可以治愈，而且不需要應用抗菌藥物治療。但如果有發熱，膿腫直徑＞5cm，一般需要切開引流，同時還需要應用抗菌藥物治療，療程足夠，一般也可以治愈；2、深部的膿腫：比如一些膿腫引起了侵襲的病灶，出現肺膿腫、膿胸或者腦膿腫，一般需要切開引流，同時應用全身的抗感染治療，療程足夠，一般也能夠根治；3、深靜脈內置的導管或者人工的瓣膜：如果是深靜脈內置的導管或者人工的瓣膜，引起金黃色葡萄球菌的感染，這種情況下單用抗菌藥物治療，一般不能夠根治，需要拔除深置的導管以及人工的瓣膜。這種情況下，如果沒有采取拔除置管這種措施，單用抗菌藥物就很難根治。另外感染性心內膜炎出現了局部的膿腫、栓塞以及穿孔，或者出現心力衰竭，這種情況下往往需要外科手術治療，否則也很難根治；4、骨髓炎：金黃色葡萄球菌引起播散性的骨髓炎，一般也需要外科首先去除死骨以及壞死組織，再配合抗菌藥物治療，否則單純應用藥物治療，也很難根治。