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肥厚型心肌病和擴張型心肌病不同，肥厚型心肌病是一種遺傳性心肌病，擴張型心肌病是一種多因素疾病，可能病人原來患有心肌炎，如病毒性、代謝性或酒精性心肌炎，或其他全身免疫性因素，最終引起心肌病變。 肥厚型心肌病是遺傳性疾病，主要改變是心肌逐漸肥厚增大，最終引起心室壁肥厚，心臟收縮時或舒張時受到一定限制，如果病人合并梗阻，稱為肥厚梗阻性心肌病。心臟收縮時，左心室流出道變窄，病人流出道變窄后供血減少，引起癥狀比如頭暈、暈厥、黑蒙。甚至在病人運動時，機體血供需要量增加，流出道血流減少，這時嚴重不平衡，最終導致猝死，所以肥厚型心肌病是青年人或運動時猝死較常見原因。擴張型心肌病是多因素疾病，最終會導致心臟的心肌細胞凋亡、壞死，使室壁變薄，心臟收縮功能下降，心臟逐漸擴大，心功能逐漸下降。病人主要表現是活動耐力下降，會出現呼吸困難，乏力，或全身浮腫。 兩者治療方法不同，肥厚型心肌病現在治療辦法是可做局部消融，把肥厚心肌組織消融，減輕局部流出道梗阻。擴張型心肌病病人通過藥物治療，甚至可合并束支阻滯，QRS波較寬的病人可做起搏治療，比如雙心室起搏治療或三腔起搏治療，甚至最終做心臟移植。