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現(xiàn)代醫(yī)學(xué)研究克羅恩病的術(shù)后復(fù)發(fā)機制還不明確，糞便、腸道連續(xù)性、遺傳和免疫等，均可影響復(fù)發(fā)。轉(zhuǎn)流回腸造口可有效治療克羅恩病的結(jié)腸炎，而發(fā)生小腸克羅恩病的風(fēng)險會降低。回腸、結(jié)腸吻合，上段進行回腸造口轉(zhuǎn)流后6個月，內(nèi)鏡及組織學(xué)檢查沒有復(fù)發(fā)，而未行轉(zhuǎn)流術(shù)后復(fù)發(fā)率高達71%，且回腸造口關(guān)閉6個月后，所有患者均會出現(xiàn)內(nèi)鏡下或者病理學(xué)上的復(fù)發(fā)。克羅恩病患者進行回結(jié)腸切除術(shù)后，其新造的末端回腸，菌落定植量是增加的。結(jié)腸切除術(shù)后活檢顯示新造的末端回腸，細菌的計數(shù)以及種類，無論是克羅恩病患者還是在對照值中都有明顯增加，而回腸造口術(shù)后并沒有這類改變。還有病例對照研究顯示，克羅恩病患者多數(shù)的大腸埃希菌以及腸道的菌落較多，所以早期復(fù)發(fā)可能與大腸埃希菌和類桿菌的計數(shù)較高有關(guān)，而且這類病人很容易分離出梭菌。