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癌胚抗原作為腫瘤標志物之一，在臨床上可以幫助診斷、評估治療的療效。化療期間腫瘤標志物下降，這是一個好現象，包括CEA在內的腫瘤標志物下降，可能預示著治療效果比較好，腫塊縮小了，腫瘤標志物就下降了。但是有些情況也會出現上升，原來是經過手術之后到正常了，過一段時間又開始往上了。 這時候要特別當心疾病復發或者病灶轉移，應該給療效評估，病情預后提到很好的提示。但是也會出現一些假陽性的情況，比如患者吃了一些對胃腸道有影響的藥物，比方臨床常見的降血脂藥，引起腹瀉，引起胃腸道癥狀的藥物，都可能造成癌胚抗原的不穩定或者波動，但這種波動通常是小范圍的，不會是高于正常上限幾倍、幾十倍。 對于這些因為外來因素造成的癌胚抗原的不穩定，可以通過調整的患者不需要的用藥，進行相關的一些干預，可能會起到比較好的干擾作用，不要出現干擾，讓患者保持一個穩定的、可信的腫瘤標志物的水平。