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凝結芽孢桿菌對人體的腸道菌群紊亂所引起的急、慢性腹瀉，以及消化不良等癥狀或者疾病能起到一定的作用，主要是因為凝結芽孢桿菌是一個既具有厭氧性質，也具有有氧性質的細菌，也就是在有氧和厭氧的條件下都能夠生存。口服凝結芽孢桿菌之后，首先經過胃到十二指腸，經過胃的胃酸作用到十二指腸就變成了營養細胞，可以和人體內的有益菌共生，達到對人體有益菌起到很好的生長作用，比如有營養細胞的繁殖就會耗氧，耗氧就使得人體的雙歧桿菌等厭氧菌有比較好的生存環境。另外也會生成維生素B，B族的維生素也會分泌淀粉酶、蛋白酶，也起到一定的助消化作用等。總而言之，凝結芽孢桿菌對人體腸道菌群的維持及腸道功能改善，有一定的功能和作用。