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CT與超聲均有各自的檢查優勢。CT可清楚了解心外結構及各大血管的連接，此外冠脈灌注，可了解冠脈走行全程，超聲針對冠脈則顯示較差。針對心內結構，CT則無B超檢查清楚，如心臟血流動力學改變、瓣膜有無狹窄、反流，房缺、室缺及外科封堵術均借助超聲進行。此外肺動脈狹窄或肺動脈閉鎖，形成較多側支，如進行心血管外科手術，需要了解側支來源及分布，應進行CT檢查。