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臨床上通過查腫瘤標志物能夠查出很多種癌癥，比如常見的肺癌、前列腺癌、肝癌、卵巢癌、乳腺癌以及胃癌、腸癌等，都可以通過某些腫瘤標志物被查出來。腫瘤標志物是由腫瘤細胞產生，并且分泌到體液當中，而被檢測到的一系列的蛋白質酶類或者其代謝產物。臨床上經常檢測的腫瘤標志物有很多種，包括常見的癌胚抗原、甲胎蛋白、鱗狀細胞癌抗原、CA-199、CA-153、CA-125、CA-724等指標。通過這些指標的增高，可能發現某些癌癥的存在。但最終確診要通過影像學檢查或者內鏡檢查去發現病變，并且通過病理學檢查來確診。不同的腫瘤標志物可能會反映不同的癌癥存在等可能性，比如甲胎蛋白增高會考慮有原發性肝癌，或者生殖腺來源的惡性腫瘤。癌胚抗原增高會考慮可能有乳腺癌、肺腺癌、腸癌、胃癌、胰腺癌的存在，鱗狀細胞癌抗原增高會考慮有皮膚癌、宮頸癌，食管癌、頭頸部惡性腫瘤的存在。