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過氧化物酶是甲狀腺合成甲狀腺激素必需的酶，平常包在甲狀腺細胞里，是不會暴露于甲狀腺細胞以外的，所以正常人體是沒有抗過氧化物酶抗體的。白細胞會產生抗體，白細胞像人體衛兵一樣或警衛一樣，不應該攻擊人體的組織，抗過氧化物酶抗體，就是人體白細胞對甲狀腺非常重要的酶發起了攻擊，產生的抗體。 抗過氧化物酶抗體升高是異常的病態過程，嚴重慢性抗過氧化物酶抗體升高就會導致甲狀腺發生橋本甲狀腺炎，嚴重的話會發生甲狀腺功能減退。正常人體是沒有抗甲狀腺過氧化物酶抗體的，一旦發生甲狀腺過氧化物酶抗體陽性，甲狀腺組織就會受到攻擊，就可能會出現甲狀腺功能減退的問題。