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檢查心臟臨床用得最多的是心超或冠狀動脈CTA檢查。磁共振檢查也可以用于心臟檢查，可以了解心臟大小、心瓣膜情況，以及是否存在反流或關閉不全。磁共振檢查也可根據心肌灌注情況，判斷心肌是否有缺血或者心肌梗死程度和范圍。但是對于心肌缺血的判斷，不如ECT或者PET-CT心臟灌注。 雖然磁共振可以用于心臟檢查，但是目前由于磁共振檢查時間非常長，同時心臟搏動會影響檢查準確性，臨床上相對使用不多。但磁共振可以做心臟冠脈成像，不需要打對比劑，碘過敏患者需要檢查心臟冠脈時，磁共振是一種不錯的選擇。