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小腸間質瘤不是絕癥，可以治療。小腸間質瘤根據腫瘤的大小和腫瘤核分裂，還分為惡性或潛在的惡性腫瘤，惡性間質瘤占10%-30%，潛在性占比較高約為70%。但潛在惡性間質瘤可以通過手術或者藥物治療進行治療，只要將腫瘤切除干凈，配合藥物治療，效果均比較好。但是惡性間質瘤容易復發或者轉移，外科治療效果相對可能會差；對于難治性間質瘤的治療，有較好的效果。 小腸間質瘤的治療以外科治療為主，因為好發在靠近回盲部，可以進行切除小腸，但要保證在切除時不能將間質瘤切破或破裂，以免引起波散或者種植。對小腸間質瘤的手術要進行完整的切除，同時手術切除以后要根據術后的腫瘤大小、病理分期或者核分裂進行分類。對于核分裂比較高或者惡性腫瘤較大的情況，術后要進行靶向治療。 小腸間質瘤80%以上CD117為陽性，對于陽性治療可以用格列衛治療，效果會比較好。對于晚期或者術后復發的間質瘤，可以進行其它二線的靶向藥物治療，治療效果也較好。因此，小腸間質瘤并不是絕癥，可以通過外科手術和藥物治療進行控制。