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甲狀腺蛋白抗體包括甲狀腺球蛋白抗體、甲狀腺的微粒體抗體、促甲狀腺激素受體抗體，上述都屬于甲狀腺自身抗體。甲狀腺相關的蛋白抗體高，主要是體內的免疫系統出現了錯誤。免疫系統本應該保護人體，但免疫系統出錯時會將甲狀腺自己的成分認為是敵人，如蛋白。從而產生自身防御，進而產生了體液免疫異常、細胞免疫異常，此時甲狀腺蛋白抗體就會增高。甲狀腺相關的蛋白抗體高，在臨床上用于診斷自身免疫性的甲狀腺疾病。但甲狀腺相關的蛋白抗體增高的最根本原因，目前并不是十分清楚。有研究發現與遺傳有關，因為有些患者有陽性的家族史；或者是與碘攝入過多有關；也可能與體內的激素水平也有一定關系，比如女性的泌乳素和性激素水平增高。若出現甲狀腺蛋白抗體高的情況，一般臨床醫生會將患者診斷為自身免疫性的甲狀腺疾病。而甲狀腺球蛋白抗體增高，也是診斷橋本甲狀腺炎的重要生化指標。若僅是甲狀腺球蛋白抗體增高，而甲狀腺功能正常，此時并不需要特別緊張。雖然此時不需要特別治療，但也需要定期復查甲狀腺激素水平。