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甲肝的檢查指標主要是血清抗體的檢測，在血清中發現甲肝IgM抗體時可以確診。患者出現癥狀時，血清中可以檢測到IgM抗體，在急性感染期和早期恢復期，IgM抗體可以達到很高的水平，并且在隨后的3-6個月仍能夠檢測到。無臨床癥狀的患者體檢時，如果測到血清IgM抗體，可能說明既往感染甲肝后，血清中長期存在IgM的抗體，是假陽性或無癥狀感染者，小于6歲的兒童比年齡更大的兒童或者成年人更常見無癥狀感染的情況。血清IgG抗體在疾病恢復早期出現，并且能夠持續存在數10年，與終身保護性免疫相關。發現甲肝IgG抗體，但沒有測出甲肝IgM抗體時，通常反應既往感染或者注射過甲肝疫苗，而不是急性感染。