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細胞毒素相關蛋白a是幽門螺桿菌所產生的，具有致病作用的毒素之一，其陽性說明體內可能感染幽門螺桿菌。由于幽門螺桿菌在體內分泌相關的蛋白、毒素，使得在檢測血清時，血清中有細胞毒素相關蛋白的表達，可以測出其陽性。幽門螺桿菌的陽性，與檢測C13或者C14陽性結果的意義一致，表明可能有幽門螺桿菌感染。如果有相關的適應證，比如對于幽門螺桿菌的是否清除，根據第5次中華醫學會幽門螺桿菌學組，所發布的專家共識，對于有十二指腸潰瘍、胃潰瘍、消化性潰瘍、家中有胃癌家族史的病人、做過胃的手術有殘胃的情況，或者需要長期服用阿司匹林、恩賽的抗炎藥，以及可能有不明原因的貧血、蕁麻疹等問題，建議清除幽門螺桿菌。