鞭毛（flagellum）運動性細菌細胞的表面著生有一根或許多根由細胞內伸出的、細長、波曲的絲狀結構，是細菌的“運動器官”。鞭毛著生的位置和數目是種的特征，具有分類鑒定意義（圖1）。根據鞭毛數目和著生情況，具鞭毛的細菌可分為：偏端單生鞭毛菌，在菌體一端只生一根鞭毛，如熒光假單孢菌；偏端叢生鞭毛，菌體一端生一束鞭毛，如銅綠假單孢菌；兩端叢生鞭毛菌，菌體兩端各具一束鞭毛，如紅色螺菌；周生鞭毛菌，菌體周身都生有鞭毛，如大腸桿菌。