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肢端肥大癥繼發于垂體生長激素瘤，是由于垂體長有分泌生長激素的腫瘤，大量的生長激素可以刺激肝臟合成和釋放胰島素樣生長因子。胰島素樣生長因子可以作用于皮膚和骨骼，導致肢端肥大癥。如果垂體的生長激素瘤發生在兒童期，在骨骺還沒有閉合的時候表現為巨人癥，如果發生在成人，就表現為肢端肥大癥。目前垂體生長激素瘤的發病機制還不明確，考慮和基因突變有關。肢端肥大癥大多數是散發的，和遺傳、家族聚集的傾向并不明顯，有少部分垂體生長激素瘤合并有甲狀旁腺腫瘤或胰腺、胃腸道腫瘤，就叫做多發性內分泌腺瘤病。多發性內分泌腺瘤病和遺傳有關，是一種常染色體顯性遺傳病。因此，除了垂體的生長激素瘤以外，還合并有甲狀旁腺腺瘤、胰腺腫瘤或者甲狀腺腫瘤，通常需要做基因檢測來檢查是否和基因突變、遺傳有關。