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新生兒聽力不好最主要的原因是遺傳因素。流行病學研究結果顯示，60%以上的新生兒聽力的問題都是遺傳因素所導致的。遺傳因素包括多種遺傳方式，例如常染色體顯性遺傳，表現為父母有一方有，孩子才會有，每一代都會有的情況，多數都是常染色體顯性遺傳。但80%以上的都是常染色體隱性遺傳，即父母聽力都是正常的。但是父母都攜帶了一個有問題的基因，并把這個有問題的基因傳給孩子。孩子的一對等位基因，即兩條染色體都出現了問題，則表現出聽力較差，稱為常染色體隱性遺傳。還有性染色體遺傳，例如X連鎖的遺傳，X染色體上的基因出現問題，有可能導致聽力也出現問題。與Y染色體相關的基因也可以導致耳聾，稱為Y染色體遺傳。除此之外，還有一種線粒體母系遺傳，細胞里邊的遺傳物質，也可以通過媽媽直接傳給孩子，媽媽有了，所有的孩子都會有。除了遺傳因素以外，在懷孕期間感染濫用藥物，例如巨細胞病毒、風疹病毒的感染，都可以導致聽覺器官發育不好，出現畸形，很多藥物具有耳毒性，如果使用這些藥物，會影響孩子的聽力，稱為藥物性耳聾。還有一些其它環境因素也可以影響聽力，如噪聲等。